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北京科大方兴科技孵化器有限责任公司（以下简称方兴孵化器）创建以来充分依托北京科技大学开放的体制和机制，与北京科技大学重点实验室携手共同建设出具有鲜明特色的科技条件平台和科技成果转移平台。2001年，方兴孵化器依托北京科技大学，建立了8个二级专业子孵化器，搭建出特色鲜明的孵育平台。方兴孵化器将市场需求和技术订单交给各专业子孵化器，专业子孵化器将产业化成果交给方兴孵化器。二级专业子孵化器打破原有传统的纯技术研发模式，引入市场机制，以方兴孵化器为平台进行孵化。为了保证此项工作的顺利进行，经过几年的摸索、尝试和创新，孵育平台已经形成一套相对完善的组织体系和运营机制，形成一套有效的成果孵化模式。在组织机构上设立了由方兴孵化器总经理和各专业孵化器负责人组成的孵化器负责人联席会议，方兴孵化器设立的投融资部、项目孵化部、财务部等部门与各专业孵化器相关部门建立了全方位的合作关系；在运营机制上通过出台《专业孵化器管理办法》、《入孵项目管理办法》、《项目入孵协议》等一系列管理制度，对双方的责、权、利进行了很好的界定，保证了市场化运作机制的顺利进行。
实践证明，这种孵化模式表现出了强大的市场竞争力和旺盛的生命力，一大批高科技成果通过这种模式得到成功转化。如"超磁致伸缩材料项目"是学校新金属材料国家重点实验室通过承担国家"863"九五、十五计划而研究出的新成果，应用该项技术可以生产出的具有自主知识产权的超磁致伸缩材料具有国际先进、国内领先水平，打破了美国等西方国家对我国的垄断和封锁。2002年8月经过反复的研究与论证，该项目作为方兴孵化器的入孵项目进入孵化器孵化，方兴孵化器为该项目提供了孵化场地400平米，孵化资金130余万，建设了一条年产500公斤的中试生产线，并配备专人为该项目提供市场调研、政策咨询、生产组织等全方位的孵化服务。在2003年4月作为"项目孵化"相对成熟后，孵化器积极为该项目寻找产业化资金，并于2003年7月为该项目成功融资3500万元，成立了"蓝天科大新材料发展有限公司"，学校以该项技术作价1500万元入股，占公司注册资本的30％。在注册成立公司后，方兴孵化器继续为其提供"企业孵化"服务，协助办理工商注册、税务登记、认定高新技术企业、开展该项目的专家评定工作等，孵化器派员参加该公司的董事会，直接参与公司的经营决策。目前该项目进展顺利，已经于2004年10月获得国家发改委立项，获专项资助资金1000万人民币，该项目所在地政府对此项目也给予极高的重视，给予项目用地200余亩，并将该项目作为贵州省重点建设项目写进了省政府2005年政府工作报告。通过对该项目的成功孵化，孵化器已获取第一笔回报资金100万元人民币，并有望于近期收回全部孵化投入。另根据与学校的约定，孵化器在该公司拥有200万股股权。
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