本次科技需求调研，在市委研究室和政府研究室支持和指导之下，从2005年9月初开始到2006年1月底结束，历时近5个月；采用主持单位和承担单位相结合的管理方式。北京市科委软科学处总体负责，北京高技术创业中心为科技需求调研项目主持单位。鉴于子课题数目多、范围广，为了保证课题组织协调工作的有序进行，市科委系统内部成立了“十一五时期北京经济社会发展科技需求调研办公室”，负责调研项目总体协调、沟通和管理工作。

    为方便调研项目的执行，“科技需求调研”项目按照总体协调把握、分类分层督导的原则，把项目分解为以下四大板块、每个板块细分为子课题。每一板块聘请一个有实力、有特色的督导单位负责跟进并撰写该板块的份报告、或组织实施。

    一、城市建设与管理板块，涉及29个委办局，承担单位包括委办局或者其委托的研究机构、下属事业单位等。北京市长城企业战略研究所为督导单位。

    二、区县工作板块，包括18个区县、中关村科技园区和亦庄经济技术开发区，承担单位为各区县科委和研究室。北京决策咨询中心为督导单位。

    三、产业发展板块，涉及北京40个细分产业或领域，承担单位为各类行业协会和学会、大学和研究院所或者是中介咨询机构。北京远迅创新科技发展有限公司为督导单位。

    四、背景与趋势板块，考虑到课题之间横向联系的需要，通过新立项或者是整合市科委的软科学研究课题的方式，形成了“背景与趋势”板块研究报告，主要由北京高技术创业服务中心负责组织实施。

    在组织项目实施时，考虑到政府部门工作紧、人力缺的情况，对于有些不能亲自撰写子课题报告的委办局和区县，请它们推荐子课题承担单位，并认可子课题承担单位的研究成报告。这样，直接承担子课题的单位有98家，这98家承担单位的分类统计如下。